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Text File  |  1995-03-04  |  1.3 KB  |  32 lines
  1. ******************************************************
  2. * Glycosyl hydrolases family 39 putative active site *
  3. ******************************************************
  4.  
  5. It has  been shown [1] that  the  following glycosyl hydrolases can be, on the
  6. basis of sequence similarities, classified into a single family:
  7.  
  8.  - Mammalian lysosomal alpha-L-iduronidase (EC 3.2.1.76).
  9.  - Caldocellum  saccharolyticum  and  Thermoanaerobacter saccharolyticum beta-
  10.    xylosidase (EC 3.2.1.37) (gene xynB).
  11.  
  12. The best  conserved  regions  in  these  enzymes is  located in the N-terminal
  13. section. It   contains  a  glutamic  acid  residue  which,  on  the  basis  of
  14. similarities with   other  families  of  glycosyl  hydrolases  [2],  could  be
  15. important for the catalytic mechanism. We have used this region as a signature
  16. pattern.
  17.  
  18. -Consensus pattern: W-x-F-E-x-W-N-E-P-[DN]
  19.                     [The second E is the putative active site residue]
  20. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  21. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  22.  
  23. -Expert(s) to contact by email: Henrissat B.
  24.                                 bernie@cermav.grenet.fr
  25.  
  26. -Last update: June 1994 / First entry.
  27.  
  28. [ 1] Henrissat B., Bairoch A.
  29.      Biochem. J. 293:781-788(1993).
  30. [ 2] Henrissat B.
  31.      Unpublished observations (1994).
  32.